عين محمد أفندي في بداية عمله في القضاء ، قاضيا في مصر ، وفي سنة 1127 ه - 1715 م ، أصبح قاضيا في استانبول ، وفي 1130 ه - 1717 - 1718 م ، تولى منصب نقيب الأشراف ( للمرة الأولى ) « 4 » ، وفي شعبان 1134 ه - أيار 1722 م ، عين في منصب قاضي عسكر الأناضول . عين محمد زين العابدين أفندي قاضيا لعسكر الروم ايلي ( للمرة الأولى ) في شوال 1140 ه - أيار 1728 م ، وفي 1141 ه - 1728 - 1729 م ، عزل من منصب نقيب الأشراف ، وفي صفر 1144 ه - آب 1731 م ، أعيد ( للمرة الثانية ) لمنصب قاضي عسكر الروم ايلي ، وفي 1145 ه - 1732 - 1733 م تولى منصب نقيب الأشراف ( للمرة الثانية ) أيضا ، وفي ذي القعدة 1152 ه - نهاية كانون الثاني - أوائل شباط 1740 م عين ( للمرة الثالثة ) في منصب قاضي عسكر الروم ، وفي سنة 1156 ه - 1743 م ، تم عزله من منصب نقيب الأشراف ، ولكن في 28 ذي القعدة 1157 ه - 2 كانون الثاني 1745 م ، أعيد إلى منصب نقيب الأشراف ورئيس العلماء ( للمرة الثالثة ) ، وفي أوائل 1159 ه - 1746 م ، تولى منصب قاضي عسكر الروم ايلي ( للمرة الرابعة ) ، واستمر فيه حتى تولى مشيخة الإسلام . مشيخته : تولى محمد أفندي منصب شيخ الإسلام ومفتي الدولة العثمانية ، في أعقاب عزل شيخ الإسلام السابق محمد أمين أفندي حياتيزاده ، وذلك في 9 شوال 1159 ه - 24 تشرين الأول 1746 م ، واستمر في هذا المنصب حتى 24 رجب 1161 ه - 20 تموز 1748 م ، حيث تم عزله لكبر سنه الذي تجاوز الثمانين عاما ، وتولى المشيخة من بعده محمد أسعد أفندي أبو إسحاق إسماعيل أفنديزاده ، وكانت مدة مشيخته ( سنة واحدة و 9 شهور و 15 يوما هجرية ) - ( سنة واحدة و 8 شهور و 26 يوما ميلادية ) ، وكان ترتيب دفعته في تسلسل شيوخ الإسلام ( 89 ) في عهد السلطان محمود الأول .

--> ( 4 ) - هناك تضارب في تاريخ تولى منصب نقابة الأشراف في هذه المرة ، مع النقيب السابق شيخ الإسلام السابق السيد عبد اللّه أفندي بشمقجيزاده ، حيث من الممكن أن يكون تاريخ تولي هذا المنصب كان 1132 ه - 1720 م .